(1)“应付账款一开开化工厂”明细账可能存在的问题有：①甲公司与开开化工厂在业务上有纠纷拒付货款；②甲公司故意拖欠货款，占用开开化工厂的资金；③可能是一方或双方记账差错；④利用应付账款隐瞒收入或利润。

　　要查明事实真相，应该进一步进行审查，方法是采用面询或函证的方法向开开化工 厂进行调查。针对不同的情况，注册会计师应作出相应的处理。

　　(2)该注册会计师应选择B公司和D公司进行应付账款余额的函证。因为函证应付账款，目的主要在于查实有无未入账的负债。本年度该公司从B和D两家公司采购了大量商品，存在漏记业务的可能性更大。