(1)建立公务员申诉、控告制度有利于维护公务员的合法权益。当公务员受到机关的不当人事处理时，有权要求给予纠正；当公务员的合法权益受到机关及其领导人员不法或不当侵害时，有权要求停止其侵害行为并追究侵害人的责任。由于公务员管理工作纷繁复杂，机关或其领导人员错误地或者违法地处理公务员的事情时有发生，有了申诉+控告制度之后，公务员就可以通过行使法律赋予自己的申诉权或者控告权维护自身的合法权益。因此，申诉、控告制度能起到保障公务员合法权益的作用。(2)建立公务员申诉、控告制度有利于保障机关公务员管理的公正性、合法性和合理性。建立公务员申诉、控告制度，在给公务员维护其合法权益提供保障的同时，也对机关公务员管理工作起到了监督作用，有利于促进机关及其领导人员提高其依法管理的水平，防止其滥用职权实施打击报复的行为发生，从而保障机关公务员管理的公正性、合法性和合理性。