答：

（1）林某应当在2008年10月25日之前向人民法院起诉。因为根据行政复议法规定，申请人对复议决定不服的，可以在收到复议决定书之日起15日内，向人民法院起诉。

（2）被告是A市公安局。根据行政诉讼法规定，经过复议的案件，经复议改变了原行政行为的，复议机关为被告。

（3）林某可以向B区公安局所在地基层人民法院或者A市公安局所在地基层人民法院起诉。因为根据行政诉讼法规定，行政案件由最初作出具体行政行为的行政机关所在地人民法院管辖。经复议的案件，复议机关改变原具体行政行为的，也可以由复议机关所在地人民法院管辖。