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在市场经济条件下政府对农业进行宏观调控的理论依据主要在于，农业本身所具有的特征导致市场在某方面失灵，依靠市场机制不能有效得解决这些问题，需要政府在市场配置资源的基础上，采取一定的政策手段加以宏观调控。导致市场在农业中失灵的主要原因在于农业的外部性、农业的公共产品性、农业的弱质性和农业的不稳定性。