(1)丙村和丁村的协议有效。根据民法原理，按份共有人行使其财产所有权时，应当按协议办理，如没有协议，则可由共有人协商一致或按多数共有人的意见办理。本案中丙村根据协议享有10万立方米蓄水量中的50%即5万立方米的用水量，其向丁村转让1万立方米的用水权的协议，经过双方协商一致，并且没有损害甲、乙两位共有人的利益，应为合法有效。 (2)甲、乙、丙三村可以以侵权为由，作为原告起诉丁村。因为水库的所有权属于甲、乙、丙三村共有，虽然丁村认为丙村故意不按约定供水，违约在先，但其挖坏堤坝的行为不仅侵犯了丙村的财产权，同时也侵犯了甲、乙两村的财产权。所以，甲、乙、丙三村可作为共同原告，要求丁村赔偿损失。